Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF3P57682 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF3P57682 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF3P57682 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms