Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms