Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSWP56202 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSWP56202 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSWP56202 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSWP56202 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms