Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF5P43026 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF5P43026 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms