Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FDFT1P37268 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FDFT1P37268 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms