Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGER4P35408 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms