Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD6P30203 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD6P30203 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD6P30203 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD6P30203 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD6P30203 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD6P30203 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD6P30203 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD6P30203 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms