Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRABP1P29762 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms