Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms