Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSSP25774 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms