Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD53P19397 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD53P19397 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD53P19397 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD53P19397 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms