Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR1P18146 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR1P18146 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR1P18146 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR1P18146 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR1P18146 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR1P18146 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EGR1P18146 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR1P18146 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms