Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms