Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF3P17036 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF3P17036 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms