Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms