Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRCP08575 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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