Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOA1P02647 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms