Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBX7O95931 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBX7O95931 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBX7O95931 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms