Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG5

FAM25C, Protein FAM25C, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25CB3EWG5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM25CB3EWG5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM25CB3EWG5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM25CB3EWG5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM25CB3EWG5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM25CB3EWG5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM25CB3EWG5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM25CB3EWG5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms