Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HACD1B0YJ81 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD1B0YJ81 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms