Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC169A6NNP5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms