Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms