Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms