Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYVE1Q9Y5Y7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms