Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms