Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SATB2Q9UPW6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SATB2Q9UPW6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms