Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAK1Q9UPV9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms