Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNRGQ9UMZ2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNRGQ9UMZ2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms