Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHIC2Q9UKJ5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms