Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms