Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRLS1Q9UJA2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms