Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKIRAS2Q9NYR9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms