Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNK4Q9NYG8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms