Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM28Q9NW13 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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