Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4L1Q9NU39 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms