Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ELL3Q9HB65 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms