Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms