Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms