Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms