Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms