Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3CQ99985 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3CQ99985 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3CQ99985 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3CQ99985 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3CQ99985 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3CQ99985 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3CQ99985 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3CQ99985 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3CQ99985 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3CQ99985 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SEMA3CQ99985 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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