Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms