Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms