Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM47Q96LD4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms