Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF496Q96IT1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms