Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms