Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms