Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EAF2Q96CJ1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EAF2Q96CJ1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms