Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 ATP2B2-203ENST00000383800 8900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.674e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 BRF1-204ENST00000392557 3579 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 ATP2B2-206ENST00000460129 9101 ntTSL 510.73□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPFIBP2-224ENST00000533792 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-254ENST00000489395 2811 ntTSL 210.71□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PARD3B-203ENST00000358768 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TRPV1-202ENST00000399756 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.774e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TRPV1-207ENST00000572705 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PSMA3-AS1-214ENST00000557660 2360 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TRPV1-203ENST00000399759 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PSMA3-AS1-209ENST00000555707 1983 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 BLMH-210ENST00000581037 788 ntTSL 59.98□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 RASSF4-201ENST00000340258 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.833e-14■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-253ENST00000488892 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.854e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-219ENST00000461300 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.854e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-239ENST00000474928 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.854e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LARGE1-207ENST00000423375 568 ntTSL 49.71□□□□□ -0.864e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 CORO1C-217ENST00000551550 547 ntTSL 49.65□□□□□ -0.864e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PSMA3-AS1-205ENST00000554378 741 ntTSL 1 (best)9.65□□□□□ -0.864e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPP6R3-224ENST00000533127 551 ntTSL 49.59□□□□□ -0.874e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPP6R3-219ENST00000529907 826 ntTSL 59.59□□□□□ -0.874e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PSMA3-AS1-204ENST00000554360 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AP000424.1-202ENST00000523831 331 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-237ENST00000472252 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AK4-205ENST00000479060 867 ntTSL 39.34□□□□□ -0.914e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 FAM222B-201ENST00000341217 4033 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.974e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-205ENST00000414866 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.984e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 MTSS1-218ENST00000529463 569 ntTSL 48.91□□□□□ -0.984e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LARGE1-209ENST00000432776 560 ntTSL 48.89□□□□□ -0.994e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.994e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 RASSF4-204ENST00000462822 354 ntTSL 38.85□□□□□ -0.993e-14■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-223ENST00000463292 642 ntTSL 1 (best)8.64□□□□□ -1.034e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-231ENST00000470746 370 ntTSL 28.63□□□□□ -1.034e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-241ENST00000476051 449 ntTSL 38.49□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.064e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPFIBP2-216ENST00000530181 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.074e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-268ENST00000602781 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-234ENST00000471017 410 ntTSL 28.31□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-267ENST00000602679 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 38.31□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPFIBP2-213ENST00000529575 780 ntTSL 38.28□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PSMA3-AS1-210ENST00000556002 1039 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.14e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SMYD3-208ENST00000464398 540 ntTSL 38.02□□□□□ -1.134e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 C14orf37-203ENST00000554218 572 ntTSL 47.98□□□□□ -1.134e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC7.78□□□□□ -1.164e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AC007040.2-202ENST00000453130 423 ntTSL 37.67□□□□□ -1.184e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.194e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.194e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.214e-6■■■■■ 41.2
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TBRG4Q969Z0 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.234e-6■■■■■ 41.2
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TBRG4Q969Z0 TBC1D23-207ENST00000485687 587 ntTSL 37.32□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-263ENST00000595571 351 ntTSL 37.14□□□□□ -1.274e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.294e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.314e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.334e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LIFR-203ENST00000503088 2371 ntTSL 1 (best)6.69□□□□□ -1.344e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-260ENST00000498269 402 ntTSL 36.64□□□□□ -1.354e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 RBL2-202ENST00000379935 4467 ntTSL 1 (best)6.47□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.394e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 WDR70-207ENST00000511906 5716 ntTSL 26.3□□□□□ -1.44e-6■■■■■ 41.2
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TBRG4Q969Z0 WWP1-203ENST00000518683 2002 ntTSL 1 (best)5.89□□□□□ -1.474e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 CPSF7-213ENST00000494016 656 ntTSL 25.87□□□□□ -1.474e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SMYD3-213ENST00000488153 653 ntTSL 35.26□□□□□ -1.574e-6■■■■■ 41.2
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TBRG4Q969Z0 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.584e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.654e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.654e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 ANKRD28-212ENST00000497037 3509 ntTSL 24.72□□□□□ -1.654e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.74e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 34.05□□□□□ -1.764e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TBC1D23-203ENST00000471098 559 ntTSL 44.04□□□□□ -1.764e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 ANKRD28-213ENST00000498524 4289 ntTSL 23.94□□□□□ -1.784e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.844e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 WWP1-205ENST00000520453 696 ntTSL 53.42□□□□□ -1.864e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TBCK-210ENST00000506280 532 ntTSL 53.07□□□□□ -1.924e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 WWP1-209ENST00000521997 641 ntTSL 33.05□□□□□ -1.924e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.014e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.074e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PTPN4-205ENST00000433888 954 ntTSL 32.05□□□□□ -2.084e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 MBD2-203ENST00000578272 701 ntTSL 51.85□□□□□ -2.114e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 WWP1-211ENST00000524036 820 ntTSL 21.79□□□□□ -2.124e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 VPS13C-205ENST00000558088 549 ntTSL 20.7□□□□□ -2.34e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 41.1
TBRG4Q969Z0 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 41.1
TBRG4Q969Z0 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 41.1
TBRG4Q969Z0 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 41.1
TBRG4Q969Z0 TNS3-205ENST00000434451 560 ntTSL 516.21■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 41
TBRG4Q969Z0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 40.9
TBRG4Q969Z0 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 40.9
TBRG4Q969Z0 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 40.9
TBRG4Q969Z0 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 40.9
TBRG4Q969Z0 SHANK2-215ENST00000470759 762 ntTSL 518.54■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 40.9
TBRG4Q969Z0 SHANK2-214ENST00000468619 2775 ntTSL 213.31□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 40.9
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