Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM87AQ8NBN3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms